Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQF4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQF4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQF4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQF4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms