Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gdpd3Q99LY2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms