Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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Cldn16Q925N4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn16Q925N4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms