Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klc3Q91W40 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms