Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sft2d2Q8VD57 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d2Q8VD57 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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