Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGK6

Ifnl3, Interferon lambda-3, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnl3Q8CGK6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ifnl3Q8CGK6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms