Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Prpf18Q8BM39 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Prpf18Q8BM39 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf18Q8BM39 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Prpf18Q8BM39 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Prpf18Q8BM39 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Prpf18Q8BM39 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Prpf18Q8BM39 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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