Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Amigo1Q80ZD8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Amigo1Q80ZD8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Amigo1Q80ZD8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Amigo1Q80ZD8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Amigo1Q80ZD8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Amigo1Q80ZD8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Amigo1Q80ZD8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Amigo1Q80ZD8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Amigo1Q80ZD8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Amigo1Q80ZD8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Amigo1Q80ZD8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Amigo1Q80ZD8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amigo1Q80ZD8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms