Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atl2Q6PA06 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms