Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zfp248Q640N4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms