Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fam208bQ5DTT3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms