Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shisa3Q3UPR0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Shisa3Q3UPR0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Shisa3Q3UPR0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Shisa3Q3UPR0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Shisa3Q3UPR0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Shisa3Q3UPR0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Shisa3Q3UPR0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Shisa3Q3UPR0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Shisa3Q3UPR0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Shisa3Q3UPR0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Shisa3Q3UPR0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Shisa3Q3UPR0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Shisa3Q3UPR0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Shisa3Q3UPR0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Shisa3Q3UPR0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Shisa3Q3UPR0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Shisa3Q3UPR0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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