Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3KNL4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3KNL4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3KNL4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3KNL4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3KNL4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3KNL4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3KNL4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms