Protein–RNA interactions for Protein: Q14BE7

Fam47c, Family with sequence similarity 47, member A, mousemouse

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Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47cQ14BE7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam47cQ14BE7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Fam47cQ14BE7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms