Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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