Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim24Q0VG18 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms