Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rcn1Q05186 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms