Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mc1rQ01727 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms