Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabpb1Q00420 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms