Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bop1P97452 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bop1P97452 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bop1P97452 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bop1P97452 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bop1P97452 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bop1P97452 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bop1P97452 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bop1P97452 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms