Protein–RNA interactions for Protein: P67871

Csnk2b, Casein kinase II subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2bP67871 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk2bP67871 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2bP67871 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms