Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UbdP63072 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UbdP63072 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UbdP63072 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UbdP63072 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
UbdP63072 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
UbdP63072 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UbdP63072 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UbdP63072 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UbdP63072 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UbdP63072 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UbdP63072 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UbdP63072 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UbdP63072 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UbdP63072 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UbdP63072 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UbdP63072 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UbdP63072 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UbdP63072 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
UbdP63072 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UbdP63072 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UbdP63072 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UbdP63072 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UbdP63072 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UbdP63072 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UbdP63072 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UbdP63072 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UbdP63072 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UbdP63072 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UbdP63072 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UbdP63072 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UbdP63072 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UbdP63072 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UbdP63072 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UbdP63072 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UbdP63072 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UbdP63072 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UbdP63072 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UbdP63072 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UbdP63072 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UbdP63072 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
UbdP63072 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UbdP63072 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
UbdP63072 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UbdP63072 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UbdP63072 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UbdP63072 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UbdP63072 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UbdP63072 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UbdP63072 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UbdP63072 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UbdP63072 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UbdP63072 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UbdP63072 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
UbdP63072 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UbdP63072 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UbdP63072 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UbdP63072 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UbdP63072 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
UbdP63072 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UbdP63072 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UbdP63072 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UbdP63072 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UbdP63072 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UbdP63072 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UbdP63072 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UbdP63072 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UbdP63072 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UbdP63072 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UbdP63072 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UbdP63072 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UbdP63072 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UbdP63072 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UbdP63072 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UbdP63072 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UbdP63072 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UbdP63072 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
UbdP63072 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UbdP63072 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UbdP63072 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UbdP63072 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UbdP63072 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UbdP63072 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UbdP63072 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UbdP63072 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UbdP63072 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UbdP63072 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UbdP63072 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UbdP63072 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UbdP63072 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UbdP63072 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UbdP63072 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UbdP63072 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UbdP63072 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UbdP63072 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UbdP63072 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UbdP63072 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UbdP63072 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UbdP63072 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UbdP63072 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms