Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms