Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox2P48432 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox2P48432 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox2P48432 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox2P48432 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox2P48432 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox2P48432 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox2P48432 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox2P48432 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox2P48432 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox2P48432 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms