Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms