Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms