Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P18524 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18524 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18524 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18524 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P18524 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18524 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18524 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18524 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18524 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18524 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P18524 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P18524 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P18524 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18524 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18524 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18524 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P18524 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18524 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18524 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P18524 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18524 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18524 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P18524 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18524 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18524 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18524 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18524 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18524 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18524 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18524 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P18524 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18524 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18524 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P18524 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P18524 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18524 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P18524 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P18524 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P18524 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18524 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P18524 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18524 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18524 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P18524 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P18524 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18524 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18524 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P18524 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P18524 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P18524 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P18524 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P18524 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P18524 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18524 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P18524 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P18524 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P18524 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18524 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18524 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18524 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18524 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18524 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18524 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
P18524 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P18524 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18524 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P18524 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P18524 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
P18524 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18524 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18524 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18524 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18524 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18524 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18524 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18524 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18524 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18524 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18524 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18524 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P18524 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P18524 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P18524 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18524 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
P18524 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18524 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
P18524 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P18524 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P18524 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18524 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P18524 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18524 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18524 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18524 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18524 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18524 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18524 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18524 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P18524 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms