Protein–RNA interactions for Protein: P06339

H2-T23, H-2 class I histocompatibility antigen, D-37 alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-T23P06339 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-T23P06339 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms