Protein–RNA interactions for Protein: P01638

Ig kappa chain V-V region L6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01638 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01638 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01638 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01638 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01638 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01638 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01638 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01638 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01638 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01638 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01638 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01638 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01638 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01638 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01638 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01638 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01638 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01638 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01638 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01638 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01638 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01638 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01638 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01638 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01638 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01638 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01638 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01638 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01638 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01638 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01638 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01638 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01638 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01638 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01638 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01638 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01638 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01638 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01638 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01638 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01638 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01638 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01638 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01638 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01638 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01638 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01638 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01638 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01638 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01638 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01638 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01638 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01638 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01638 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01638 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01638 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01638 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01638 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01638 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01638 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01638 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01638 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01638 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01638 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01638 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01638 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01638 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01638 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01638 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01638 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01638 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01638 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01638 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01638 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01638 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01638 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01638 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01638 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01638 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01638 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01638 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01638 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01638 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01638 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01638 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01638 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01638 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01638 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01638 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01638 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01638 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01638 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01638 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01638 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01638 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01638 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01638 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01638 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01638 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01638 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms