Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
F11rO88792 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
F11rO88792 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
F11rO88792 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
F11rO88792 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
F11rO88792 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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F11rO88792 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
F11rO88792 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
F11rO88792 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
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F11rO88792 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
F11rO88792 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
F11rO88792 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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F11rO88792 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
F11rO88792 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
F11rO88792 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
F11rO88792 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
F11rO88792 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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F11rO88792 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
F11rO88792 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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F11rO88792 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
F11rO88792 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
F11rO88792 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
F11rO88792 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
F11rO88792 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
F11rO88792 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
F11rO88792 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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F11rO88792 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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F11rO88792 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
F11rO88792 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
F11rO88792 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
F11rO88792 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
F11rO88792 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
F11rO88792 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
F11rO88792 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
F11rO88792 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
F11rO88792 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
F11rO88792 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
F11rO88792 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
F11rO88792 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
F11rO88792 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
F11rO88792 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
F11rO88792 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
F11rO88792 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
F11rO88792 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
F11rO88792 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
F11rO88792 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
F11rO88792 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
F11rO88792 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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