Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms