Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms