Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Gm21310J3QQ23 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Gm21310J3QQ23 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Gm21310J3QQ23 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Gm21310J3QQ23 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Gm21310J3QQ23 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Gm21310J3QQ23 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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