Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms