Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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