Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP29Q9HBJ7 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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