Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms