Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
GCSAMQ8N6F7 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms