Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC38Q502W7 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.6 ms