Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
CNGB1Q14028 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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CNGB1Q14028 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNGB1Q14028 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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