Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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