Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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TOP3AQ13472 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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TOP3AQ13472 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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TOP3AQ13472 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC130366.1-201ENST00000526505 1192 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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TOP3AQ13472 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
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TOP3AQ13472 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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TOP3AQ13472 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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TOP3AQ13472 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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TOP3AQ13472 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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TOP3AQ13472 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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TOP3AQ13472 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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