Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AHSP-201ENST00000302312 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 SPATA45-201ENST00000332912 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 NPPA-AS1-201ENST00000400892 936 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AL157932.1-201ENST00000413246 363 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC011998.2-201ENST00000430884 473 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 FTLP17-201ENST00000432567 525 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 MAP1LC3BP1-202ENST00000438342 516 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AL606462.1-201ENST00000447187 451 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC092610.1-201ENST00000454916 373 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AL031864.2-201ENST00000498507 350 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AL109628.2-201ENST00000554037 201 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC013652.1-204ENST00000558209 489 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC120498.4-201ENST00000561649 320 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 RN7SL49P-201ENST00000581392 298 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 RN7SL155P-201ENST00000581538 263 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 RN7SL378P-201ENST00000582657 298 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 ZNF793-AS1-205ENST00000589025 560 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC005329.2-202ENST00000589673 392 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 ZNF83-210ENST00000597161 509 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 ZNF98-205ENST00000601553 566 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AL109933.4-201ENST00000612111 157 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 CAMKMT-210ENST00000613618 594 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 Metazoa_SRP.123-201ENST00000616695 286 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AL353747.4-202ENST00000625787 674 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.3 ms