Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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HOXD13P35453 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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HOXD13P35453 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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HOXD13P35453 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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HOXD13P35453 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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