Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA13P31271 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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