Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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USP18Q9UMW8 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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USP18Q9UMW8 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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USP18Q9UMW8 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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USP18Q9UMW8 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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USP18Q9UMW8 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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USP18Q9UMW8 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
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