Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.1 ms