Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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TMIEQ8NEW7 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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TMIEQ8NEW7 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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TMIEQ8NEW7 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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TMIEQ8NEW7 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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TMIEQ8NEW7 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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TMIEQ8NEW7 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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TMIEQ8NEW7 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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TMIEQ8NEW7 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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TMIEQ8NEW7 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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TMIEQ8NEW7 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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TMIEQ8NEW7 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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TMIEQ8NEW7 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TMIEQ8NEW7 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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