Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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CCDC142Q17RM4 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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CCDC142Q17RM4 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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CCDC142Q17RM4 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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CCDC142Q17RM4 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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