Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 198.6 ms